Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TAF6P49848 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TAF6P49848 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TAF6P49848 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TAF6P49848 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF6P49848 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF6P49848 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF6P49848 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TAF6P49848 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF6P49848 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF6P49848 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF6P49848 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF6P49848 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF6P49848 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TAF6P49848 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TAF6P49848 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TAF6P49848 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TAF6P49848 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms