Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GCLCP48506 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLCP48506 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLCP48506 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLCP48506 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLCP48506 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLCP48506 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GCLCP48506 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GCLCP48506 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCLCP48506 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCLCP48506 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCLCP48506 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCLCP48506 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCLCP48506 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCLCP48506 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GCLCP48506 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCLCP48506 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCLCP48506 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLCP48506 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLCP48506 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLCP48506 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLCP48506 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLCP48506 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLCP48506 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCLCP48506 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLCP48506 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLCP48506 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLCP48506 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCLCP48506 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCLCP48506 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GCLCP48506 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms