Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TM4SF4P48230 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TM4SF4P48230 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.2 ms