Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL21P46778 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL21P46778 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RPL21P46778 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL21P46778 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL21P46778 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL21P46778 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL21P46778 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL21P46778 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL21P46778 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL21P46778 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL21P46778 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL21P46778 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL21P46778 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL21P46778 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL21P46778 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms