Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDKN1BP46527 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN1BP46527 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms