Protein–RNA interactions for Protein: P46087

NOP2, Probable 28S rRNA (cytosine(4447)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP2P46087 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NOP2P46087 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOP2P46087 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP2P46087 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP2P46087 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP2P46087 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP2P46087 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP2P46087 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP2P46087 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOP2P46087 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOP2P46087 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP2P46087 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP2P46087 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP2P46087 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP2P46087 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP2P46087 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOP2P46087 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOP2P46087 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOP2P46087 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOP2P46087 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOP2P46087 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOP2P46087 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOP2P46087 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NOP2P46087 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms