Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CRATP43155 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CRATP43155 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRATP43155 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRATP43155 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRATP43155 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRATP43155 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRATP43155 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CRATP43155 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CRATP43155 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CRATP43155 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CRATP43155 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CRATP43155 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CRATP43155 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CRATP43155 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CRATP43155 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms