Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGIRP43119 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGIRP43119 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms