Protein–RNA interactions for Protein: P42839

VNX1, Low affinity vacuolar monovalent cation/H(+) antiporter, yeastyeast

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VNX1P42839 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YER137C-AYER137C-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YER159C-AYER159C-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YJR026WYJR026W 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YJR028WYJR028W 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YAR010CYAR010C 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YML040WYML040W 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YML045W-AYML045W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YMR051CYMR051C 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 MRPL11YDL202W 750 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 CIA1YDR267C 993 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YJR038CYJR038C 363 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YPR170CYPR170C 336 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YJL045WYJL045W 1905 nt7.39□□□□□ -1.23
VNX1P42839 HCM1YCR065W 1695 nt7.38□□□□□ -1.23
VNX1P42839 CTK1YKL139W 1587 nt7.38□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt7.38□□□□□ -1.23
VNX1P42839 RPS1BYML063W 768 nt7.38□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YDL094CYDL094C 510 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 TVP15YDR100W 432 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 BNA1YJR025C 534 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YKR041WYKR041W 753 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 FSH3YOR280C 801 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 TAF14YPL129W 735 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 TAF12YDR145W 1620 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 MET3YJR010W 1536 nt7.37□□□□□ -1.23
VNX1P42839 APA2YDR530C 978 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YER076W-AYER076W-A 348 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 RPB9YGL070C 369 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 KAE1YKR038C 1161 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 SWS2YNL081C 432 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 PRE10YOR362C 867 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 TAE1YBR261C 699 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 snR54snR54 86 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 SPH1YLR313C 1593 nt7.36□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YPD1YDL235C 504 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 FAL1YDR021W 1200 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YGR017WYGR017W 894 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 PRE5YMR314W 705 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 SDH8YBR269C 417 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 APE1YKL103C 1545 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 TMS1YDR105C 1422 nt7.35□□□□□ -1.23
VNX1P42839 BAP3YDR046C 1815 nt7.34□□□□□ -1.23
VNX1P42839 RAD28YDR030C 1521 nt7.34□□□□□ -1.23
VNX1P42839 POR2YIL114C 846 nt7.34□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt7.34□□□□□ -1.23
VNX1P42839 PDP3YLR455W 915 nt7.34□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YPC1YBR183W 951 nt7.34□□□□□ -1.23
VNX1P42839 YMR155WYMR155W 1644 nt7.34□□□□□ -1.24
VNX1P42839 DIP5YPL265W 1827 nt7.34□□□□□ -1.24
VNX1P42839 ADE12YNL220W 1302 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 PEX29YDR479C 1665 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 snR5snR5 204 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 AYR1YIL124W 894 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 YKL107WYKL107W 930 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 YOL114CYOL114C 609 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 ERG11YHR007C 1593 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 YPL247CYPL247C 1572 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 VPS52YDR484W 1926 nt7.33□□□□□ -1.24
VNX1P42839 LAP2YNL045W 2016 nt7.32□□□□□ -1.24
VNX1P42839 YCL068CYCL068C 783 nt7.32□□□□□ -1.24
VNX1P42839 RRP45YDR280W 918 nt7.32□□□□□ -1.24
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