Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMPOP42166 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMPOP42166 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMPOP42166 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TMPOP42166 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TMPOP42166 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TMPOP42166 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TMPOP42166 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMPOP42166 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMPOP42166 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TMPOP42166 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TMPOP42166 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMPOP42166 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TMPOP42166 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPOP42166 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPOP42166 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPOP42166 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPOP42166 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPOP42166 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TMPOP42166 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TMPOP42166 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms