Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
APOBEC1P41238 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
APOBEC1P41238 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms