Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFBP38117 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFBP38117 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ETFBP38117 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ETFBP38117 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETFBP38117 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETFBP38117 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETFBP38117 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ETFBP38117 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ETFBP38117 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ETFBP38117 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ETFBP38117 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ETFBP38117 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ETFBP38117 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ETFBP38117 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ETFBP38117 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFBP38117 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFBP38117 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFBP38117 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFBP38117 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFBP38117 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ETFBP38117 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms