Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJC1P36383 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJC1P36383 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJC1P36383 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJC1P36383 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJC1P36383 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJC1P36383 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJC1P36383 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJC1P36383 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GJC1P36383 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms