Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN7P35236 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN7P35236 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms