Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
APOBEC3AP31941 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3AP31941 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms