Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLIP1P30622 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLIP1P30622 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLIP1P30622 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms