Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA5P30532 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA5P30532 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA5P30532 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms