Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD1P29536 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD1P29536 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms