Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTGFP29279 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTGFP29279 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTGFP29279 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTGFP29279 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTGFP29279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTGFP29279 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTGFP29279 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTGFP29279 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTGFP29279 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTGFP29279 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTGFP29279 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTGFP29279 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTGFP29279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTGFP29279 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms