Protein–RNA interactions for Protein: P28908

TNFRSF8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF8P28908 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF8P28908 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF8P28908 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms