Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ABCD3P28288 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ABCD3P28288 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms