Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKBIAP25963 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NFKBIAP25963 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NFKBIAP25963 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms