Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
POLR2AP24928 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR2AP24928 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms