Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5F1P24539 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms