Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PAX3P23760 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PAX3P23760 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PAX3P23760 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PAX3P23760 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PAX3P23760 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PAX3P23760 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PAX3P23760 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PAX3P23760 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms