Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA1P22314 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA1P22314 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA1P22314 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA1P22314 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA1P22314 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA1P22314 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA1P22314 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA1P22314 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA1P22314 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA1P22314 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA1P22314 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBA1P22314 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBA1P22314 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBA1P22314 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBA1P22314 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA1P22314 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA1P22314 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBA1P22314 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA1P22314 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA1P22314 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA1P22314 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA1P22314 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBA1P22314 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms