Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABCB4P21439 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABCB4P21439 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms