Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP2B1P20020 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP2B1P20020 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms