Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TFE3P19532 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TFE3P19532 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFE3P19532 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFE3P19532 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFE3P19532 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TFE3P19532 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TFE3P19532 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TFE3P19532 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TFE3P19532 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TFE3P19532 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TFE3P19532 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TFE3P19532 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TFE3P19532 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms