Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ERCC3P19447 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERCC3P19447 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms