Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR2CP19387 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR2CP19387 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms