Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCLP19338 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCLP19338 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCLP19338 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NCLP19338 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCLP19338 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCLP19338 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCLP19338 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCLP19338 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCLP19338 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NCLP19338 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCLP19338 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCLP19338 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCLP19338 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCLP19338 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCLP19338 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCLP19338 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCLP19338 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCLP19338 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCLP19338 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms