Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EGR1P18146 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EGR1P18146 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EGR1P18146 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EGR1P18146 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EGR1P18146 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EGR1P18146 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EGR1P18146 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EGR1P18146 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms