Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN1P18031 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms