Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDE6AP16499 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PDE6AP16499 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDE6AP16499 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms