Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB4P16144 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB4P16144 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms