Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG2P13727 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG2P13727 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRG2P13727 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRG2P13727 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms