Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CKBP12277 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CKBP12277 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CKBP12277 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CKBP12277 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKBP12277 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKBP12277 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKBP12277 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKBP12277 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKBP12277 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CKBP12277 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CKBP12277 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CKBP12277 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CKBP12277 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKBP12277 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKBP12277 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CKBP12277 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKBP12277 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CKBP12277 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CKBP12277 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKBP12277 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKBP12277 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKBP12277 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKBP12277 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKBP12277 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CKBP12277 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKBP12277 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKBP12277 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKBP12277 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKBP12277 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms