Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFHP12036 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEFHP12036 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEFHP12036 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEFHP12036 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NEFHP12036 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NEFHP12036 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NEFHP12036 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NEFHP12036 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NEFHP12036 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NEFHP12036 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms