Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRFP11831 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRFP11831 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRFP11831 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRFP11831 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRFP11831 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFP11831 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFP11831 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFP11831 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFP11831 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFP11831 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFP11831 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRFP11831 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRFP11831 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRFP11831 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRFP11831 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRFP11831 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRFP11831 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms