Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARBP10826 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RARBP10826 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RARBP10826 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARBP10826 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARBP10826 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARBP10826 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARBP10826 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RARBP10826 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARBP10826 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARBP10826 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARBP10826 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARBP10826 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RARBP10826 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RARBP10826 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RARBP10826 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARBP10826 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARBP10826 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARBP10826 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARBP10826 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARBP10826 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RARBP10826 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RARBP10826 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RARBP10826 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RARBP10826 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RARBP10826 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RARBP10826 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RARBP10826 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RARBP10826 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARBP10826 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARBP10826 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARBP10826 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARBP10826 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARBP10826 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RARBP10826 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms