Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPRFP10586 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRFP10586 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms