Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM225BP0DP42 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TMEM225BP0DP42 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TMEM225BP0DP42 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms