Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms