Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRGAP2CP0DJJ0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms