Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
UBBP0CG47 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBBP0CG47 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms