Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSD2O96028 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSD2O96028 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSD2O96028 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSD2O96028 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSD2O96028 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NSD2O96028 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NSD2O96028 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NSD2O96028 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NSD2O96028 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NSD2O96028 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NSD2O96028 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NSD2O96028 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
NSD2O96028 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
NSD2O96028 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
NSD2O96028 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NSD2O96028 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NSD2O96028 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSD2O96028 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSD2O96028 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSD2O96028 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NSD2O96028 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSD2O96028 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSD2O96028 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSD2O96028 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSD2O96028 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSD2O96028 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSD2O96028 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSD2O96028 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSD2O96028 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NSD2O96028 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSD2O96028 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NSD2O96028 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSD2O96028 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NSD2O96028 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSD2O96028 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSD2O96028 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NSD2O96028 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NSD2O96028 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms