Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTDNEP1O95476 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1O95476 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1O95476 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms