Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM2O94769 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM2O94769 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ECM2O94769 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM2O94769 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM2O94769 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM2O94769 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM2O94769 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ECM2O94769 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms