Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
CSDE1O75534 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSDE1O75534 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms